GENOME POPULATIONS INTERACTIONS ADAPTATION

CNRS - UMR 5171



UNIVERSITE MONTPELLIER 2
CC 63 BAT.  24
PLACE EUGENE BATAILLON
34095 MONTPELLIER CEDEX 5
Tel : 04 67 14 38 87
Fax : 04 67 14 45 54
Mél : bonhomme@univ-montp2.fr
STATION MEDIT. D'ENVIRON. LITTORAL
 
1 QUAI DE LA DAURADE
34200 SETE
Tel : 04 67 46 33 90
Fax : 04 67 46 33 99
Mél : bonhomme@univ-montp2.fr


Les membres du laboratoire 

Equipes et thèmes de recherche

Publications

Logiciels développés au laboratoire / Softwares

Conservatoire génétique de souris sauvages

Serveur CNRS sciences de la vie: UMR5171



Liste du personnel au 1 er Janvier 2003 :
NOM                             PRENOM      STATUT                           ADRESSE

AUJOULAT

Fabien

Agent Technique

fabien.aujoulat@univ-montp2.fr

BELKHIR

Khalid

Ingénieur de Recherches

belkhir@univ-montp2.fr

BIERNE Nicolas Chargé de recherches CNRS  

BLASCO

Claudine

Technicienne

blasco@univ-montp2.fr

BONARIC

Jean Claude

Maître de Conférences

bonaric@univ-montp2.fr

BONHOMME

François

Directeur de Recherches CNRS

bonhomme@univ-montp2.fr

BOURSOT

Pierre

Directeur de Recherches CNRS

boursot@univ-montp2.fr

CAMINADE

Pierre

Technicien CNRS

caminade@univ-montp2.fr

CASTILLE

René

Maître de Conférences

castille@univ-montp2.fr

CHARMANTIER

Guy

Professeur

charmantier@univ-montp2.fr

CHARMANTIER-DAURES

Mireille

Maître de Conférences

charmantier.daures@univ-montp2.fr

DE LA SERRE

Isabelle

Secrétaire CNRS

delaserre@univ-montp2.fr

DESMARAIS

Erick

Ingénieur de Recherches CNRS

desmarais@univ-montp2.fr

DIETRICH

Jacques

Chercheur IFREMER

jacques.dietrich@ifremer.fr

DOD

Barbara

Chargée de Recherches CNRS

dod@univ-montp2.fr

DUQUESNE

Jean-Jacques

Adjoint Technique CNRS

duquesne@univ-montp2.fr

EUZET

Sylvie

Technicienne CNRS

euzet-sicard@univ-montp2.fr

FERDY

Jean-Baptiste

Maître de Conférences

ferdy@univ-montp2.fr

GALTIER

Nicolas

Chargé de recherches CNRS

galtier@univ-montp2.fr

GLEMIN Sylvain Maître de Conférences  

GODELLE

Bernard

Professeur

godelle@univ-montp2.fr

GROUSSET

Evelyse

Adjoint Technique

egrousset@univ-montp2.fr

GUINAND

Bruno

Maître de Conférences

guinand@univ-montp2.fr

JAILLETTE

Mylène

Secrétaire Contractuelle

mjaillette@univ-montp2.fr

LAMBERT

Alain

Maître de Conférences

lambert@univ-montp2.fr

LAMBERT

Emeline

Technicienne CNRS

e-lambert@univ-montp2.fr

LE BRUN

Nathalie

Ingénieur d’études

nlb@univ-montp2.fr

LOUBES

Claude

Maître de Conférences

cloubes@univ-montp2.fr

MOULIA

Catherine

Maître de Conférences

moulia@univ-montp2.fr

NEGRE-SADARGUES

Geneviève

Maître de Conférences

negre@univ-montp2.fr

ORTH

Annie

Ingénieur d'études

a-orth@crit.univ-montp2.fr

PAUPLIN

Yves

Chargé de recherches CNRS

pauplin@univ-montp2.fr

ROLLAND

Jean-Luc

Assistant Ingénieur IFREMER

jlrollan@ifremer.fr

SILAN

Patrick

Chargé de recherches CNRS

silan@univ-montp2.fr

SPANINGS-PIERROT

Céline

Maître de Conférences

pierrot@univ-montp2.fr

TRILLES

Jean-Paul

Professeur Emérite

trilles@univ-montp2.fr

VERSINI

Jean-Jacques

Ingénieur MESR

versini@univ-montp2.fr

 
Chercheurs IRD accueillis au laboratoire
AGNESE Jean-François Chargé de Recherches IRD agnese@univ-montp2.fr
DURAND Jean-Dominique Chargé de Recherches IRD jddurand@mpl.ird.fr
RENNO Jean-François Chargé de Recherches IRD j-francois.renno@mpl.orstom.fr


Etudiants en thèse :

Nom
Prénom
Statut
Adresse
Début de la Thèse
ANDRE Jean-Baptiste Doctorant MESR jbandre@univ-montp2.fr 2000
BAZIN Eric Doctorant MESR bazin@univ-montp2.fr 2002
CIELUCH Ude Doctorant ucieluch@awi-bremerhaven.de  
GUILLAUMET Alban Doctorant MESR aguillaumet@univ-montp2.fr 2001
GULDNER Emilie Doctorante MESR guldner@univ-montp2.fr 2000
HASSAN Mohamad Doctorant MAE m-hassan@univ-montp2.fr 1999
KHODABANDEH Saber Doctorant saberkh@univ-montp2.fr  
NEBEL Catherine Doctorante cathynebel@post.club-internet.fr  
PORCHERIE Adeline Doctorante a-porcherie@free.fr 2001
ROLLAND Jean-Luc   Doctorant IFREMER jlrollan@ifremer.fr 2001
SERRANO Laetitia Doctorante serrano@univ-montp2.fr  
SICARD Mathieu Doctorant MESR sicard@univ-montp2.fr 2000

Thème(s) des équipes et responsables (Responsable ; Participants)

mots clés : Génétique, Populations, Evolution, Spéciation, Hôtes/Parasites, Génome, Adaptation, Ecophysiologie, Phylogéographie.


Génomique et G énétique Evolutive  
Histoire des gènes impliqués dans la divergence fonctionnelle entre génomes, génétique de la spéciation et génomique évolutive des souris du genre Mus
-Phylogéographie comparée et histoire des gènes dans le genre Mus.
-Recherche des déterminants de la biodiversité génomique chez la souris.
-Architecture génétique des incompatibilités entre génomes : Analyse des patrons d’introgression dans une zone hybride.
-Recherche active des gènes impliqués dans la divergence fonctionnelle entre génomes.
-Bioinformatique pour la génomique évolutive
Pierre Boursot ( Resp. )


P. Boursot, B. Dod, F.Bonhomme, N. Galtier, A. Orth, Y. Pauplin, P. Caminade, E. Desmarais, S. Glemin , K. Belkhir

Génétique des P opulations Marines
Structure génétique des espèces marines, impact de la phase planctonique sur les flux de gènes, le déterminisme du recrutement et l’adaptation aux conditions de milieu
-Analyse de la structuration géographique de plusieurs espèces de poissons de la façade atlantique (sole, anchois,).
-Identification de gènes impliqués dans la différentiation mer-lagune chez le loup D. labrax et fonctionnement des populations naturelles face à la sélection disruptive.
-Variabilité spatio-temporelle du recrutement chez les bivalves
-Analyse fine d’une barrière au flux génique en milieu marin : la zone de transition de la Mer d’Alboran.
François Bonhomme (Resp. )

 

F. Bonhomme, B. Guinand, J.J. Versini, J. Dietrich, J.L. Rolland, E. Lambert,  N. Bierne
Interactions
Coévolution dans les interactions hétérospécifiques, parasitoses, mutualismes. Approches théoriques et expérimentales, déterminisme génétique, impact sur l'évolution des génomes
-Systématique, biodiversité, biogéographie et évolution des systèmes hôtes-parasites
-Rôle du parasitisme dans l'évolution des zones d'hybridation hôtes : Associations souris / nématodes intestinaux
-Analyse écologique et évolutive de l'association mutualiste entre nématodes entomophages et bactéries symbiotiques
-Approche théorique et modélisation des interactions parasitaires et mutualistes
-Evolution moléculaire de l’Hémoglobine chez les plantes et acquisition symbiotique de l’azote
Catherine Moulia ( Resp. )



C. Moulia, B. Godelle, J.B. Ferdy, N. LeBrun, A. Lambert, J.C. Bonaric, C. Loubes, S. Euzet, E. Desmarais.
Adaptation

Adaptation écophysiologique aux facteurs du milieu au cours de l’ontogenèse des animaux aquatiques, poissons et crustacés.

De l’organisme aux niveaux cellulaire et moléculaire.

- Ontogenèse des mécanismes osmorégulateurs au niveau des sites : chambres branchiales, intestin, reins.

- Différenciation ontogénétique des ionocytes.

- Activité et contrôle de l’expression des canaux ioniques et hydriques et des transporteurs ioniques.

- Contrôle neuroendocrine de l’osmorégulation.

- Génétique et physiologie de l’adaptation du loup D. Labrax au milieu lagunaire.

GUY CHARMANTIER (Resp.)

 

G. Charmantier, F. Bonhomme, R. Castille, M. Charmantier-Daures, G. Nègre-Sadargues, C. Spanings-Pierrot, F. Aujoulat, C. Blasco, E. Grousset.






Programmes développés au laboratoire GPI :

GENETIQUE DES POPULATIONS
GENETIX v4.05 Programmes pour la génétique des populations
PARTITION Bayesian identification of population sub-division
PARTITION ML M.L. test of population sub-division / Test M.V. de partition de population
NEUTRALLELIX v1.0 Test de neutralité / Neutrality Test
Manuscript IDENTIX1.1 Permutation test of relatedness/ Test d'apparentement par permutation
SWEEP_BOTT Detecting bottlenecks and selective sweeps
DETSEL Program to detect markers responding to selection
PHYLOGENIE
PHYLO_WIN v1.2 Graphical interface to molecular phylogeny
NHML v3 Non-homogeneous maximum likelihood for phylogenetics
BAOBAB Program for editing and displaying large trees
 Bases de données biologiques
Polymorphix
base de données de polymorphisme intraspécifique de séquences nucléotidiques
intraspecific polymorphism database of nuleotidic sequences

 Bibliothèques de code
BioPP
Bio++ est un ensemble de codes sources pour le developpement d'application en phylogénie et en génétique des populations
Bio++ is a set of C++ libraries for Bioinformatics, including

sequence analysis, phylogenetics, molecular evolution and population genetics